Ficheiro:Nitrogenase general catalytic scheme.svg

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Descrição
English: A general catalytic mechanism scheme for nitrogenase. A) Components I and II are dissociated; II is ready for reduction. B) ATP binds to component II, which receives electrons from an electron donor (ferredoxin or flavodoxin); binding of ATP induces an allosteric conformational change which allows association of the two proteins. Electrons flow from the [4Fe-4S] cluster on II to the P cluster on I. C) Electrons are further shuttled to the iron-molybdenum cofactor (FeMoco), and ATP is hydrolised to ADP. This step is repeated several times before a molecule of N2 can bind to FeMoco. D) The protein complex dissociates, and nitrogenase reduces dinitrogen to ammonia and dihydrogen. I: component I (dinitrogenase; MoFe protein); II: component II (dinitrogen reductase; Fe protein); ATP: adenosine triphosphate; ADP: adenosine diphosphate; Fdx: ferredoxin; Fld: flavodoxin.

The precise order of some of these steps is not totally understood, and therefore this scheme should not be seen as an established mechanism.

[4Fe-4S] cluster was traced from PDB file 2NIP; P cluster and FeMoco were traced from PDB file 1M1N.

Sources:

  • Seefeldt, L.C.; Hoffman, B.M., Dean, D.R. (2009). "Mechanism of Mo-Dependent Nitrogenase", Annu Rev Biochem 78: 701-22. DOI:10.1146/annurev.biochem.78.070907.103812
  • Burgess, B.K.; Lowe, D.J. (1996). "Mechanism of Molybdenum Nitrogenase", Chem. Rev. 96: 2983–3012. ACS Publications. DOI:10.1021/cr950055x
  • Barney, B.M.; Lee, H.-I., dos Santos, P.C., Hoffman, B.M., Dean, D.R., Seefeldt, L.C. (2006). "Breaking the N2 triple bond: insights into the nitrogenase mechanism", Dalton Trans. 19: 2277-84. RSC Publishing. DOI:10.1039/B517633F
Português: Esquema geral do mecanismo catalítico da nitrogenase. A) As componentes I e II encontram-se dissociadas; II está pronta para ser reduzida. B) O ATP liga-se à componente II, que por sua vez recebe electrões de um dador electrónico; a ligação do ATP induz uma mudança conformacional alostérica que permite a associação das duas proteínas. Ocorre transferência de electrões do centro [4Fe-4S] de II para o centro P de I. C) Os electrões são transportados para o centro FeMo e o ATP é hidrolisado a ADP. Este passo ocorre diversas vezes antes da ligação de um N2 ao centro FeMo. D) O complexo proteico dissocia-se e a nitrogenase reduz o N2 a NH3 e H2. I: componente I; II: componente II; Fdx: ferredoxina; Fld: flavodoxina.

A ordem exacta de alguns destes passos não é totalmente conhecida e por isso este esquema não deve ser encarado como um mecanismo estabelecido.

O centro [4Fe-4S] foi desenhado a partir do ficheiro PDB 2NIP; os centro FeMo e P foram desenhados a partir do ficheiro PDB 1M1N.

Fontes:

  • Seefeldt, L.C.; Hoffman, B.M., Dean, D.R. (2009). "Mechanism of Mo-Dependent Nitrogenase", Annu Rev Biochem 78: 701-22. DOI:10.1146/annurev.biochem.78.070907.103812
  • Burgess, B.K.; Lowe, D.J. (1996). "Mechanism of Molybdenum Nitrogenase", Chem. Rev. 96: 2983–3012. ACS Publications. DOI:10.1021/cr950055x
  • Barney, B.M.; Lee, H.-I., dos Santos, P.C., Hoffman, B.M., Dean, D.R., Seefeldt, L.C. (2006). "Breaking the N2 triple bond: insights into the nitrogenase mechanism", Dalton Trans. 19: 2277-84. RSC Publishing. DOI:10.1039/B517633F
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